甘肃中医学院附属医院脾胃病科组建于1996年，目前已发展成为我省具有鲜明特色的中西医结合治疗消化疾病的临床医疗、教学、科研基地之一。现有医生11名，其中正高职4人，副高职4人，中职1人，初职2人；护理人员12名。科室现设置编制床位25张，配有奥林帕斯电子胃肠镜、高频电刀，碳14呼气试验检测幽门螺旋杆菌分析仪，彩色B超，全自动生化分析仪等大、中型医疗设备。科室拥有国家中医药管理局认证的消化病中医药研究二级重点实验室，对消化系统的慢性胃炎、功能性胃肠病、慢性肝炎及肝硬化、脂肪肝、消化内科肿瘤相关性疾病等能开展系统中西医结合的临床诊治及系统研究。科室拥有脾胃病科诊室、肝病专科诊室、消化肿瘤专科诊室共3个特色诊室，并负责我院肠道门诊的日常临床工作。近5年平均每年住院病人总数近300余人次，病床使用率约80%左右。 

科室针对慢性胃炎、肝硬化、脂肪肝三种疾病研制出健脾活血通络胶囊、平胃胶囊、胃安胶囊、慈姑化脂胶囊、化纤保肝胶囊等专方专药，结合中医针灸、药浴、中药塌渍等多种特色治疗方法综合治疗，临床效果显著。
科室发展中亦始终坚持以科研带动临床，以临床支持科研的科学发展理念，近五年共在国内外学术期刊发表学术论文共 130篇；其中国家级 40篇。主持或参与国家级课题7项，完成省级科研课题27项，获奖12项。主编或合作出版学术专著、教材21部。