肛肠科是一个有独特专科疗法、特色鲜明的肛肠专科，是福建省的重点专科，尤其对于直肠脱垂的治疗，经过多年努力，已成为国家级重点专科直肠脱垂专病协作组6家成员之一，拥有主任医师1人，主治医师2人，住院医师4人，其中具有硕士研究生学历3人，护理人员12名，逐渐形成一支经验丰富人员梯队结构合理的临床、科研队伍。我院肛肠科设有35张床位，环境优美、整洁、安静、宽敞、舒适，堪称省内一流。同时配备有各种先进医疗设备，包括电脑肛肠检查治疗系统、结肠水疗仪、微波治疗仪、电动手术床、监护仪、电脑肛肠药物熏洗椅、高频电刀、自动升降检查床、冷光源乙状结肠镜等。
     本科兼收并蓄国内外的先进技术，以中西医结合手术治疗为主，配合内服、外用中药，应用灌肠、熏洗、外敷、针灸、结扎、挂线、枯痔、微波、热疗等技术，并参以现代先进的医疗仪器(如LC电脑肛肠病检查治疗系统、电脑薰洗坐浴椅、微波治疗仪、结肠水疗仪、肛肠腔内治疗仪、高频电刀等)，对各种肛肠疾患(内痔、外痔、混合痔、肛裂、肛周脓肿、肛瘘、便秘、炎症性肠病、肛周皮肤病等)及肛肠复杂疑难病的治疗，在术式设计与治疗方案上等均有特色。我科目前开展的特色手术治疗有消痔灵注射治疗直肠脱垂、肛裂侧切术、混合痔分段齿形结扎术、高位复杂性肛瘘低切高挂旷置引流术、中药保留灌肠治疗结肠炎、便秘等。对肛门复杂疑难病的治疗，如环状混合痔、复杂性肛瘘、出口梗阻性便秘等，手术水准达到全省领先、国内先进水平，并具有治愈率高、痛苦少、无后遗症、费用少等明显优势。 “电脑肛肠检查治疗仪诊治各类肛肠疾病”、“B超、彩超诊断肛周脓肿、肛瘘”、“综合疗法治疗环状混合痔”、“复杂性肛瘘切挂留桥旷置术”、“微波治疗仪”、“电脑熏洗坐浴仪、结肠水疗仪在肛肠科的应用”、“保留灌肠治疗各类肠道疾病”等技术在省内达到先进水平。本科尤其对便秘的中西医结合治疗有独特之处，对出口梗阻性便秘的治疗技术居全国先进水平。制定了肛肠常见病诊疗规范及危急重症救治规范，制定了“痔病”、“脱肛”、“肛漏”三个重点病种的诊疗常规及临床路径，并每年分析、总结、优化。2005年至今开展了“自动痔疮套扎术、肛肠内腔治疗仪在肛肠疾病临床应用、中药保留灌肠治疗直肠粘膜内脱垂、消痔灵注射治疗直肠粘膜内脱垂所致便秘”等8项新技术项目。
     专科病房位于医技楼六、七两层，为独立的病区，门诊位于医技楼二楼。拥有门诊、病区、手术室、换药室、抢救室、中药熏洗坐浴室、微波治疗室等