厦门大学附属中山医院呼吸内科是厦门市规划重点学科，现有医护人员60余人，其中高级职称6人（主任医师3人，副主任医师2人，副主任护士1人），有教授、硕士研究生导师、享受国务院政府特殊津贴专家、博士和硕士。科室设有两个病区，编制床位90张。每天开放呼吸专科门诊三间，呼吸专家门诊两间。另开设 “成人哮喘专家门诊”，“肺部肿瘤门诊”，鼾症门诊和戒烟门诊。年出院病人2000余人次；年门诊量5万余人次。

病区设有10张病床的呼吸重症监护病房，内设中央监护、层流和重症VIP病房，拥有瑞士产新型（金型）伽利略，爱尔兰产新型PB840、德国产新型德尔格Evita-4和瑞典产新型西门子Servo-i等一批高档有创呼吸机，美国伟康无创呼吸机及美国惠普监护仪；按国际标准建有隔音墙壁，红外线摄像和对讲系统的国内一流的睡眠呼吸监测中心，配备全球一流，澳大利亚Compumedics无线遥距睡眠监测系统；病区设有优质病房8间和多媒体中控投影示教室。

科室附设800平方米世界一流的现代一体化的呼吸内镜和肺功能综合诊疗部，内设支气管镜术前麻醉准备间，呼吸内镜检查室3间和呼吸内镜洗消中心，配备日本产支气管镜诊治系统3套；设有肺功能检查室2间（运动心肺检查室1间），肺功能雾化治疗室1间，配备价值170万元的全球最先进、国内独家、最新型、高级组合模块式、数字化并可无限升级的全配套（包括体描、运动等）的德国原装进口的JAEGER（耶格）专业肺功能检测系统；设有呼吸内镜和肺功能示教室（装备辐射支气管镜和肺功能各个检查室的红外线摄像系统和多媒体投影），内设呼吸实验室3间，配备先进的试验仪器；内设资料室1间及其他附属设施。

科室招收培养厦门大学医学院和福建医科大学呼吸专业科研型和临床型的研究生。承担厦门大学医学院全部和福建医科大学部分临床医学专业本科生的呼吸诊断和呼吸内科学的临床理论、见习和实习课等教学任务。承担厦门大学医学院护理系和福建医科大学护理学院护理本科生和厦门医高专护理专科生的部分理论、见习和实习课等教学任务。我科现是“中国呼吸道感染优化治疗协作组”和“全国肺栓塞防治协作组”成员单位。国务院非典督查组组长欧新黔和原福建省委书记、省长卢展工等领导曾来访我科。现任中华医学会会长，中华医学会原呼吸病学分会主任委员，中国工程院院士钟南山教授于2002年4月和2009年10月先后两次莅临我科视察。